Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21738J3QP72 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21738J3QP72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21738J3QP72 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21738J3QP72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms