Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Smim22J3QP37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
Smim22J3QP37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Smim22J3QP37 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Smim22J3QP37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Smim22J3QP37 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
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