Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700014D04RikJ3QMS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700014D04RikJ3QMS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms