Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm7971J3QMM8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm7971J3QMM8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7971J3QMM8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7971J3QMM8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms