Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21060J3KMU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21060J3KMU4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms