Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933406M09RikG3XA12 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933406M09RikG3XA12 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933406M09RikG3XA12 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933406M09RikG3XA12 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms