Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms