Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp32F8VPZ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp32F8VPZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Usp32F8VPZ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp32F8VPZ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Usp32F8VPZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Usp32F8VPZ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp32F8VPZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms