Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colca2F8VPY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colca2F8VPY8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colca2F8VPY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colca2F8VPY8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Colca2F8VPY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms