Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4aF8VPX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4aF8VPX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4aF8VPX6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4aF8VPX6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4aF8VPX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4aF8VPX6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4aF8VPX6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4aF8VPX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Speer4aF8VPX6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4aF8VPX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4aF8VPX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms