Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Farp1F8VPU2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Farp1F8VPU2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Farp1F8VPU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Farp1F8VPU2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms