Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl9F7BE40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arl9F7BE40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arl9F7BE40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arl9F7BE40 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms