Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm28038F7BCN9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28038F7BCN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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