Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2564F6Z9S8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm2564F6Z9S8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2564F6Z9S8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2564F6Z9S8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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