Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21970F6XX07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21970F6XX07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21970F6XX07 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms