Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3072F6SKY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3072F6SKY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3072F6SKY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms