Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd7E9Q9W7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd7E9Q9W7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd7E9Q9W7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd7E9Q9W7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd7E9Q9W7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms