Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930451I11RikE9Q9R3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930451I11RikE9Q9R3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
4930451I11RikE9Q9R3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930451I11RikE9Q9R3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms