Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrdnE9Q9K5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrdnE9Q9K5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrdnE9Q9K5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TrdnE9Q9K5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TrdnE9Q9K5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TrdnE9Q9K5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms