Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5407E9Q7Q1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Gm5407E9Q7Q1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Gm5407E9Q7Q1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5407E9Q7Q1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Gm5407E9Q7Q1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Gm5407E9Q7Q1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Gm5407E9Q7Q1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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Gm5407E9Q7Q1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Gm5407E9Q7Q1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Gm5407E9Q7Q1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm5407E9Q7Q1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Gm5407E9Q7Q1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Gm5407E9Q7Q1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Gm5407E9Q7Q1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm5407E9Q7Q1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5407E9Q7Q1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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