Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pate1E9Q658 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pate1E9Q658 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pate1E9Q658 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pate1E9Q658 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pate1E9Q658 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms