Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtproE9Q612 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtproE9Q612 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtproE9Q612 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtproE9Q612 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtproE9Q612 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms