Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip11E9Q512 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trip11E9Q512 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trip11E9Q512 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip11E9Q512 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip11E9Q512 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms