Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Speer4f2E9Q366 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4f2E9Q366 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4f2E9Q366 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4f2E9Q366 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f2E9Q366 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f2E9Q366 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4f2E9Q366 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms