Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3250E9Q1M3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3250E9Q1M3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3250E9Q1M3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms