Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd2E9Q1M1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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