Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Scaf11E9PZM7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Scaf11E9PZM7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Scaf11E9PZM7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Scaf11E9PZM7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Scaf11E9PZM7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Scaf11E9PZM7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms