Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30bE9PVL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30bE9PVL6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30bE9PVL6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30bE9PVL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms