Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930444G20RikD3Z741 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4930444G20RikD3Z741 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930444G20RikD3Z741 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930444G20RikD3Z741 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms