Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ2

Gm5239, MCG1031578, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5239D3YYZ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5239D3YYZ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5239D3YYZ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5239D3YYZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5239D3YYZ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms