Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf217D3YYI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf217D3YYI7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf217D3YYI7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf217D3YYI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf217D3YYI7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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