Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim30cD3YVI9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim30cD3YVI9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30cD3YVI9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30cD3YVI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30cD3YVI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms