Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930444P10RikD3YUR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444P10RikD3YUR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930444P10RikD3YUR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930444P10RikD3YUR1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms