Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga9B8JK39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga9B8JK39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga9B8JK39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga9B8JK39 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms