Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnldc1B2RXZ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pnldc1B2RXZ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms