Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cped1B2RX70 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cped1B2RX70 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cped1B2RX70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cped1B2RX70 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cped1B2RX70 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms