Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hbb-bh2B2RVB7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms