Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5483B2RV77 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5483B2RV77 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm5483B2RV77 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5483B2RV77 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms