Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usf3B2RUQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usf3B2RUQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usf3B2RUQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usf3B2RUQ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms