Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H60cB1B213 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H60cB1B213 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H60cB1B213 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H60cB1B213 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H60cB1B213 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H60cB1B213 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H60cB1B213 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H60cB1B213 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H60cB1B213 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H60cB1B213 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H60cB1B213 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H60cB1B213 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H60cB1B213 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H60cB1B213 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H60cB1B213 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H60cB1B213 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H60cB1B213 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H60cB1B213 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H60cB1B213 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H60cB1B213 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H60cB1B213 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H60cB1B213 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
H60cB1B213 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms