Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spocd1B1ASB6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spocd1B1ASB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spocd1B1ASB6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spocd1B1ASB6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms