Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfap221A9Q751 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap221A9Q751 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap221A9Q751 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap221A9Q751 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms