Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll3A4Q9E5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll3A4Q9E5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll3A4Q9E5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll3A4Q9E5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.5 ms