Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc9bA3KGF9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc9bA3KGF9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc9bA3KGF9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc9bA3KGF9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc9bA3KGF9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms