Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Btbd35f28A2CFD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Btbd35f28A2CFD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Btbd35f28A2CFD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Btbd35f28A2CFD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Btbd35f28A2CFD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Btbd35f28A2CFD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Btbd35f28A2CFD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms