Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fibcd1A2AV25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fibcd1A2AV25 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fibcd1A2AV25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fibcd1A2AV25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms