Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl41A2AUC9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl41A2AUC9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl41A2AUC9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhl41A2AUC9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl41A2AUC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms