Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Frmpd1A2AKB4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
Frmpd1A2AKB4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Frmpd1A2AKB4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
Frmpd1A2AKB4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Frmpd1A2AKB4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Frmpd1A2AKB4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Frmpd1A2AKB4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Frmpd1A2AKB4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Frmpd1A2AKB4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Frmpd1A2AKB4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Frmpd1A2AKB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms