Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc39aA2ACP1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc39aA2ACP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc39aA2ACP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39aA2ACP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39aA2ACP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms