Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Prdm16A2A935 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Prdm16A2A935 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Prdm16A2A935 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prdm16A2A935 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prdm16A2A935 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Prdm16A2A935 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prdm16A2A935 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prdm16A2A935 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms