Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprfA2A8L5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprfA2A8L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprfA2A8L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprfA2A8L5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms